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  • Branch: Laboratory of Genomic Susceptibility

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Authors: Dawson ET,  Wagner S,  Roberson D,  Yeager M,  Boland J,  Garrison E,  Chanock S,  Schiffman M,  Raine-Bennett T,  Lorey T,  Castle PE,  Mirabello L,  Durbin R
Title: Viral coinfection analysis using a MinHash toolkit.
Journal: BMC Bioinformatics 20(1):389
Date: 2019 Jul 12
Branches: CGB, CGR, LGS, OD
PubMed ID: 31299914
PMC ID: PMC6626348

Authors: Laskar RS,  Muller DC,  Li P,  Machiela MJ,  Ye Y,  Gaborieau V,  Foll M,  Hofmann JN,  Colli L,  Sampson JN,  Wang Z,  Bacq-Daian D,  Boland A,  Abedi-Ardekani B,  Durand G,  Le Calvez-Kelm F,  Robinot N,  Blanche H,  Prokhortchouk E,  Skryabin KG,  Burdett L,  Yeager M,  Radojevic-Skodric S,  Savic S,  Foretova L,  Holcatova I,  Janout V,  Mates D,  Rascu S,  Mukeria A,  Zaridze D,  Bencko V,  Cybulski C,  Fabianova E,  Jinga V,  Lissowska J,  Lubinski J,  Navratilova M,  Rudnai P,  Świątkowska B,  Benhamou S,  Cancel-Tassin G,  Cussenot O,  Trichopoulou A,  Riboli E,  Overvad K,  Panico S,  Ljungberg B,  Sitaram RT,  Giles GG,  Milne RL,  Severi G,  Bruinsma F,  Fletcher T,  Koppova K,  Larsson SC,  Wolk A,  Banks RE,  Selby PJ,  Easton DF,  Pharoah P,  Andreotti G,  Beane Freeman LE,  Koutros S,  Albanes D,  Männistö S,  Weinstein S,  Clark PE,  Edwards TL,  Lipworth L,  Carol H,  Freedman ML,  Pomerantz MM,  Cho E,  Kraft P,  Preston MA,  Wilson KM,  Michael Gaziano J,  Sesso HD,  Black A,  Freedman ND,  Huang WY,  Anema JG,  Kahnoski RJ,  Lane BR,  Noyes SL,  Petillo D,  Teh BT,  Peters U,  White E,  Anderson GL,  Johnson L,  Luo J,  Chow WH,  Moore LE,  Choueiri TK,  Wood C,  Johansson M,  McKay JD,  Brown KM,  Rothman N,  Lathrop MG,  Deleuze JF,  Wu X,  Brennan P,  Chanock SJ,  Purdue MP,  Scelo G
Title: Sex specific associations in genome wide association analysis of renal cell carcinoma.
Journal: Eur J Hum Genet
Date: 2019 Jun 23
Branches: BB, CGR, ITEB, LGS, LTG, MEB, OD, OEEB
PubMed ID: 31231134
PMC ID: not available

Authors: Machiela MJ,  Myers TA,  Lyons CJ,  Koster R,  Figg WD Jr,  Colli LM,  Jessop L,  Ahearn TU,  Freedman ND,  García-Closas M,  Chanock SJ
Title: Detectible mosaic truncating PPM1D mutations, age and breast cancer risk.
Journal: J Hum Genet 64(6):545-550
Date: 2019 Jun
Branches: CGR, ITEB, LGS, MEB, OD
PubMed ID: 30850729
PMC ID: not available

Authors: Plassais J,  Kim J,  Davis BW,  Karyadi DM,  Hogan AN,  Harris AC,  Decker B,  Parker HG,  Ostrander EA
Title: Whole genome sequencing of canids reveals genomic regions under selection and variants influencing morphology.
Journal: Nat Commun 10(1):1489
Date: 2019 Apr 2
Branches: LGS
PubMed ID: 30940804
PMC ID: PMC6445083

Authors: Johansson M,  Carreras-Torres R,  Scelo G,  Purdue MP,  Mariosa D,  Muller DC,  Timpson NJ,  Haycock PC,  Brown KM,  Wang Z,  Ye Y,  Hofmann JN,  Foll M,  Gaborieau V,  Machiela MJ,  Colli LM,  Li P,  Garnier JG,  Blanche H,  Boland A,  Burdette L,  Prokhortchouk E,  Skryabin KG,  Yeager M,  Radojevic-Skodric S,  Ognjanovic S,  Foretova L,  Holcatova I,  Janout V,  Mates D,  Mukeriya A,  Rascu S,  Zaridze D,  Bencko V,  Cybulski C,  Fabianova E,  Jinga V,  Lissowska J,  Lubinski J,  Navratilova M,  Rudnai P,  Benhamou S,  Cancel-Tassin G,  Cussenot O,  Weiderpass E,  Ljungberg B,  Tumkur Sitaram R,  Häggström C,  Bruinsma F,  Jordan SJ,  Severi G,  Winship I,  Hveem K,  Vatten LJ,  Fletcher T,  Larsson SC,  Wolk A,  Banks RE,  Selby PJ,  Easton DF,  Andreotti G,  Beane Freeman LE,  Koutros S,  Männistö S,  Weinstein S,  Clark PE,  Edwards TL,  Lipworth L,  Gapstur SM,  Stevens VL,  Carol H,  Freedman ML,  Pomerantz MM,  Cho E,  Wilson KM,  Gaziano JM,  Sesso HD,  Freedman ND,  Parker AS,  Eckel-Passow JE,  Huang WY,  Kahnoski RJ,  Lane BR,  Noyes SL,  Petillo D,  Teh BT,  Peters U,  White E,  Anderson GL,  Johnson L,  Luo J,  Buring J,  Lee IM,  Chow WH,  Moore LE,  Eisen T,  Henrion M,  Larkin J,  Barman P,  Leibovich BC,  Choueiri TK,  Lathrop GM,  Deleuze JF,  Gunter M,  McKay JD,  Wu X,  Houlston RS,  Chanock SJ,  Relton C,  Richards JB,  Martin RM,  Davey Smith G,  Brennan P
Title: The influence of obesity-related factors in the etiology of renal cell carcinoma-A mendelian randomization study.
Journal: PLoS Med 16(1):e1002724
Date: 2019 Jan
Branches: CGR, ITEB, LGS, LTG, MEB, OD, OEEB
PubMed ID: 30605491
PMC ID: PMC6317776

Authors: Choudhuri Avik,  Trompouki Eirini,  Abraham Brian J.,  Colli Leandro,  Mallard William,  Yang Min-Lee,  Vinjamur Divya,  Ghamari Alireza,  Nandakumar Satish,  Hoi Kanen,  Hummel Barbara,  Boatman Sonja,  Chan Victoria,  Bowman Teresa V.,  Yang Song,  Zhou Yi,  Takahashi Sinichiro,  Cantor Alan B.,  Sankaran Vijay G.,  Ganesh Santhi,  Bauer Daniel E.,  Rinn John,  Chanock Stephen J.,  Young Richard A.,  Zon Leonard I.
Title: Transcriptional Signaling Centers Govern Human Erythropoiesis and Harbor Genetic Variations of Red Blood Cell Traits
Journal: Blood 132(Suppl 1):Abstract 1277
Date: 2018 Nov 29
Branches: CGR, LGS, OD
PubMed ID: not available
PMC ID: not available

Authors: Lupo P,  Brown A,  Arroyo V,  Belmont J,  Scheurer M,  Foster K,  Kern D,  Leisenring W,  Okcu F,  Yasui Y,  Morton L,  Chanock S,  Robison L,  Armstrong G,  Bhatia S,  Oeffingers K,  Kamdar K
Title: Genome-Wide Association Study to Identify Obesity Susceptibility Loci in Survivors of Childhood Acute Lymphoblastic Leukemia (ALL): A Report from the Childhood Cancer Survivor Study (CCSS)
Journal: Pediatr Blood Cancer 65(Suppl 2):S41-072
Date: 2018 Nov
Branches: LGS, OD, REB
PubMed ID: not available
PMC ID: not available

Authors: McMaster ML,  Berndt SI,  Zhang J,  Slager SL,  Li SA,  Vajdic CM,  Smedby KE,  Yan H,  Birmann BM,  Brown EE,  Smith A,  Kleinstern G,  Fansler MM,  Mayr C,  Zhu B,  Chung CC,  Park JH,  Burdette L,  Hicks BD,  Hutchinson A,  Teras LR,  Adami HO,  Bracci PM,  McKay J,  Monnereau A,  Link BK,  Vermeulen RCH,  Ansell SM,  Maria A,  Diver WR,  Melbye M,  Ojesina AI,  Kraft P,  Boffetta P,  Clavel J,  Giovannucci E,  Besson CM,  Canzian F,  Travis RC,  Vineis P,  Weiderpass E,  Montalvan R,  Wang Z,  Yeager M,  Becker N,  Benavente Y,  Brennan P,  Foretova L,  Maynadie M,  Nieters A,  de Sanjose S,  Staines A,  Conde L,  Riby J,  Glimelius B,  Hjalgrim H,  Pradhan N,  Feldman AL,  Novak AJ,  Lawrence C,  Bassig BA,  Lan Q,  Zheng T,  North KE,  Tinker LF,  Cozen W,  Severson RK,  Hofmann JN,  Zhang Y,  Jackson RD,  Morton LM,  Purdue MP,  Chatterjee N,  Offit K,  Cerhan JR,  Chanock SJ,  Rothman N,  Vijai J,  Goldin LR,  Skibola CF,  Caporaso NE
Title: Two high-risk susceptibility loci at 6p25.3 and 14q32.13 for Waldenström macroglobulinemia.
Journal: Nat Commun 9(1):4182
Date: 2018 Oct 10
Branches: BB, CGB, CGR, EBP, ITEB, LGS, OD, OEEB, REB
PubMed ID: 30305637
PMC ID: PMC6180091

Authors: Chanock SJ
Title: Gene editing reveals the effect of thousands of variants in a key cancer gene.
Journal: Nature 562(7726):201-202
Date: 2018 Oct
Branches: LGS, OD
PubMed ID: 30291308
PMC ID: not available

Authors: Farci Patrizia,  Engle Ronald E.,  Wollenberg Kurt,  Chanock Stephen J.,  Dean Michael,  Zamboni Fausto
Title: An Integrated Genomic Approach Identifies a Distinct Molecular Signature of Hepatitis D Virus-Associated Hepatocellular Carcinoma (HCC) Compared with HCC Associated with Other Hepatitis Viruses
Journal: Hepatology 68(Suppl 1):320A, Abstract 532
Date: 2018 Oct
Branches: CGR, LGS, LTG, OD
PubMed ID: not available
PMC ID: not available

Authors: Jones CC,  Mercaldo SF,  Blume JD,  Wenzlaff AS,  Schwartz AG,  Chen H,  Deppen SA,  Bush WS,  Crawford DC,  Chanock SJ,  Blot WJ,  Grogan EL,  Aldrich MC
Title: Racial Disparities in Lung Cancer Survival: The Contribution of Stage, Treatment, and Ancestry.
Journal: J Thorac Oncol 13(10):1464-1473
Date: 2018 Oct
Branches: LGS, OD
PubMed ID: 29885480
PMC ID: PMC6153049 [available on October 01, 2019]

Authors: Machiela MJ,  Hofmann JN,  Carreras-Torres R,  Brown KM,  Johansson M,  Wang Z,  Foll M,  Li P,  Rothman N,  Savage SA,  Gaborieau V,  McKay JD,  Ye Y,  Henrion M,  Bruinsma F,  Jordan S,  Severi G,  Hveem K,  Vatten LJ,  Fletcher T,  Koppova K,  Larsson SC,  Wolk A,  Banks RE,  Selby PJ,  Easton DF,  Pharoah P,  Andreotti G,  Freeman LEB,  Koutros S,  Albanes D,  Mannisto S,  Weinstein S,  Clark PE,  Edwards TE,  Lipworth L,  Gapstur SM,  Stevens VL,  Carol H,  Freedman ML,  Pomerantz MM,  Cho E,  Kraft P,  Preston MA,  Wilson KM,  Gaziano JM,  Sesso HS,  Black A,  Freedman ND,  Huang WY,  Anema JG,  Kahnoski RJ,  Lane BR,  Noyes SL,  Petillo D,  Colli LM,  Sampson JN,  Besse C,  Blanche H,  Boland A,  Burdette L,  Prokhortchouk E,  Skryabin KG,  Yeager M,  Mijuskovic M,  Ognjanovic M,  Foretova L,  Holcatova I,  Janout V,  Mates D,  Mukeriya A,  Rascu S,  Zaridze D,  Bencko V,  Cybulski C,  Fabianova E,  Jinga V,  Lissowska J,  Lubinski J,  Navratilova M,  Rudnai P,  Szeszenia-Dabrowska N,  Benhamou S,  Cancel-Tassin G,  Cussenot O,  Bueno-de-Mesquita HBA,  Canzian F,  Duell EJ,  Ljungberg B,  Sitaram RT,  Peters U,  White E,  Anderson GL,  Johnson L,  Luo J,  Buring J,  Lee IM,  Chow WH,  Moore LE,  Wood C,  Eisen T,  Larkin J,  Choueiri TK,  Lathrop GM,  Teh BT,  Deleuze JF,  Wu X,  Houlston RS,  Brennan P,  Chanock SJ,  Scelo G,  Purdue MP
Title: Corrigendum re "Genetic Variants Related to Longer Telomere Length are Associated with Increased Risk of Renal Cell Carcinoma" [Eur Urol 2017;72:747-54].
Journal: Eur Urol 74(3):e85-e86
Date: 2018 Sep
Branches: BB, CGB, CGR, ITEB, LGS, LTG, MEB, OD, OEEB
PubMed ID: 29853305
PMC ID: not available

Authors: Loftfield E,  Zhou W,  Graubard BI,  Yeager M,  Chanock SJ,  Freedman ND,  Machiela MJ
Title: Predictors of mosaic chromosome Y loss and associations with mortality in the UK Biobank.
Journal: Sci Rep 8(1):12316
Date: 2018 Aug 17
Branches: BB, CGR, ITEB, LGS, MEB, OD
PubMed ID: 30120341
PMC ID: PMC6098142

Authors: Ji X,  Bossé Y,  Landi MT,  Gui J,  Xiao X,  Qian D,  Joubert P,  Lamontagne M,  Li Y,  Gorlov I,  de Biasi M,  Han Y,  Gorlova O,  Hung RJ,  Wu X,  McKay J,  Zong X,  Carreras-Torres R,  Christiani DC,  Caporaso N,  Johansson M,  Liu G,  Bojesen SE,  Le Marchand L,  Albanes D,  Bickeböller H,  Aldrich MC,  Bush WS,  Tardon A,  Rennert G,  Chen C,  Teare MD,  Field JK,  Kiemeney LA,  Lazarus P,  Haugen A,  Lam S,  Schabath MB,  Andrew AS,  Shen H,  Hong YC,  Yuan JM,  Bertazzi PA,  Pesatori AC,  Ye Y,  Diao N,  Su L,  Zhang R,  Brhane Y,  Leighl N,  Johansen JS,  Mellemgaard A,  Saliba W,  Haiman C,  Wilkens L,  Fernandez-Somoano A,  Fernandez-Tardon G,  van der Heijden EHFM,  Kim JH,  Dai J,  Hu Z,  Davies MPA,  Marcus MW,  Brunnström H,  Manjer J,  Melander O,  Muller DC,  Overvad K,  Trichopoulou A,  Tumino R,  Doherty J,  Goodman GE,  Cox A,  Taylor F,  Woll P,  Brüske I,  Manz J,  Muley T,  Risch A,  Rosenberger A,  Grankvist K,  Johansson M,  Shepherd F,  Tsao MS,  Arnold SM,  Haura EB,  Bolca C,  Holcatova I,  Janout V,  Kontic M,  Lissowska J,  Mukeria A,  Ognjanovic S,  Orlowski TM,  Scelo G,  Swiatkowska B,  Zaridze D,  Bakke P,  Skaug V,  Zienolddiny S,  Duell EJ,  Butler LM,  Koh WP,  Gao YT,  Houlston R,  McLaughlin J,  Stevens V,  Nickle DC,  Obeidat M,  Timens W,  Zhu B,  Song L,  Artigas MS,  Tobin MD,  Wain LV,  Gu F,  Byun J,  Kamal A,  Zhu D,  Tyndale RF,  Wei WQ,  Chanock S,  Brennan P,  Amos CI
Title: Identification of susceptibility pathways for the role of chromosome 15q25.1 in modifying lung cancer risk.
Journal: Nat Commun 9(1):3221
Date: 2018 Aug 13
Branches: BB, EBP, ITEB, LGS, MEB, OD, OEEB
PubMed ID: 30104567
PMC ID: PMC6089967

Authors: Machiela MJ,  Grünewald TGP,  Surdez D,  Reynaud S,  Mirabeau O,  Karlins E,  Rubio RA,  Zaidi S,  Grossetete-Lalami S,  Ballet S,  Lapouble E,  Laurence V,  Michon J,  Pierron G,  Kovar H,  Gaspar N,  Kontny U,  González-Neira A,  Picci P,  Alonso J,  Patino-Garcia A,  Corradini N,  Bérard PM,  Freedman ND,  Rothman N,  Dagnall CL,  Burdett L,  Jones K,  Manning M,  Wyatt K,  Zhou W,  Yeager M,  Cox DG,  Hoover RN,  Khan J,  Armstrong GT,  Leisenring WM,  Bhatia S,  Robison LL,  Kulozik AE,  Kriebel J,  Meitinger T,  Metzler M,  Hartmann W,  Strauch K,  Kirchner T,  Dirksen U,  Morton LM,  Mirabello L,  Tucker MA,  Tirode F,  Chanock SJ,  Delattre O
Title: Genome-wide association study identifies multiple new loci associated with Ewing sarcoma susceptibility.
Journal: Nat Commun 9(1):3184
Date: 2018 Aug 9
Branches: CGB, CGR, EBP, HGP, ITEB, LGS, MEB, OD, OEEB, REB
PubMed ID: 30093639
PMC ID: PMC6085378

Authors: O'Mara TA,  Glubb DM,  Amant F,  Annibali D,  Ashton K,  Attia J,  Auer PL,  Beckmann MW,  Black A,  Bolla MK,  Brauch H,  Brenner H,  Brinton L,  Buchanan DD,  Burwinkel B,  Chang-Claude J,  Chanock SJ,  Chen C,  Chen MM,  Cheng THT,  Clarke CL,  Clendenning M,  Cook LS,  Couch FJ,  Cox A,  Crous-Bous M,  Czene K,  Day F,  Dennis J,  Depreeuw J,  Doherty JA,  Dörk T,  Dowdy SC,  Dürst M,  Ekici AB,  Fasching PA,  Fridley BL,  Friedenreich CM,  Fritschi L,  Fung J,  García-Closas M,  Gaudet MM,  Giles GG,  Goode EL,  Gorman M,  Haiman CA,  Hall P,  Hankison SE,  Healey CS,  Hein A,  Hillemanns P,  Hodgson S,  Hoivik EA,  Holliday EG,  Hopper JL,  Hunter DJ,  Jones A,  Krakstad C,  Kristensen VN,  Lambrechts D,  Marchand LL,  Liang X,  Lindblom A,  Lissowska J,  Long J,  Lu L,  Magliocco AM,  Martin L,  McEvoy M,  Meindl A,  Michailidou K,  Milne RL,  Mints M,  Montgomery GW,  Nassir R,  Olsson H,  Orlow I,  Otton G,  Palles C,  Perry JRB,  Peto J,  Pooler L,  Prescott J,  Proietto T,  Rebbeck TR,  Risch HA,  Rogers PAW,  Rübner M,  Runnebaum I,  Sacerdote C,  Sarto GE,  Schumacher F,  Scott RJ,  Setiawan VW,  Shah M,  Sheng X,  Shu XO,  Southey MC,  Swerdlow AJ,  Tham E,  Trovik J,  Turman C,  Tyrer JP,  Vachon C,  VanDen Berg D,  Vanderstichele A,  Wang Z,  Webb PM,  Wentzensen N,  Werner HMJ,  Winham SJ,  Wolk A,  Xia L,  Xiang YB,  Yang HP,  Yu H,  Zheng W,  Pharoah PDP,  Dunning AM,  Kraft P,  De Vivo I,  Tomlinson I,  Easton DF,  Spurdle AB,  Thompson DJ
Title: Identification of nine new susceptibility loci for endometrial cancer.
Journal: Nat Commun 9(1):3166
Date: 2018 Aug 9
Branches: CGB, CGR, ITEB, LGS, MEB, OD, OEEB
PubMed ID: 30093612
PMC ID: PMC6085317

Authors: Kreimer AR,  Herrero R,  Sampson JN,  Porras C,  Lowy DR,  Schiller JT,  Schiffman M,  Rodriguez AC,  Chanock S,  Jimenez S,  Schussler J,  Gail MH,  Safaeian M,  Kemp TJ,  Cortes B,  Pinto LA,  Hildesheim A,  Gonzalez P,  Costa Rica HPV Vaccine Trial (CVT) Group
Title: Evidence for single-dose protection by the bivalent HPV vaccine-Review of the Costa Rica HPV vaccine trial and future research studies.
Journal: Vaccine 36(32 Pt A):4774-4782
Date: 2018 Aug 6
Branches: BB, CGB, EBP, IIB, LGS, MEB, OD
PubMed ID: 29366703
PMC ID: PMC6054558

Authors: Brooke RJ,  Im C,  Wilson CL,  Krasin MJ,  Liu Q,  Li Z,  Sapkota Y,  Moon W,  Morton LM,  Wu G,  Wang Z,  Chen W,  Howell RM,  Armstrong GT,  Bhatia S,  Mostoufi-Moab S,  Seidel K,  Chanock SJ,  Zhang J,  Green DM,  Sklar CA,  Hudson MM,  Robison LL,  Chemaitilly W,  Yasui Y
Title: A High-risk Haplotype for Premature Menopause in Childhood Cancer Survivors Exposed to Gonadotoxic Therapy.
Journal: J Natl Cancer Inst 110(8):895-904
Date: 2018 Aug 1
Branches: CGR, LGS, OD, REB
PubMed ID: 29432556
PMC ID: PMC6093389

Authors: Wang SS,  Carrington M,  Berndt SI,  Slager SL,  Bracci PM,  Voutsinas J,  Cerhan JR,  Smedby KE,  Hjalgrim H,  Vijai J,  Morton LM,  Vermeulen R,  Paltiel O,  Vajdic CM,  Linet MS,  Nieters A,  de Sanjose S,  Cozen W,  Brown EE,  Turner J,  Spinelli JJ,  Zheng T,  Birmann BM,  Flowers CR,  Becker N,  Holly EA,  Kane E,  Weisenburger D,  Maynadie M,  Cocco P,  Albanes D,  Weinstein SJ,  Teras LR,  Diver WR,  Lax SJ,  Travis RC,  Kaaks R,  Riboli E,  Benavente Y,  Brennan P,  McKay J,  Delfau-Larue MH,  Link BK,  Magnani C,  Ennas MG,  Latte G,  Feldman AL,  Doo NW,  Giles GG,  Southey MC,  Milne RL,  Offit K,  Musinsky J,  Arslan AA,  Purdue MP,  Adami HO,  Melbye M,  Glimelius B,  Conde L,  Camp NJ,  Glenn M,  Curtin K,  Clavel J,  Monnereau A,  Cox DG,  Ghesquières H,  Salles G,  Bofetta P,  Foretova L,  Staines A,  Davis S,  Severson RK,  Lan Q,  Brooks-Wilson A,  Smith MT,  Roman E,  Kricker A,  Zhang Y,  Kraft P,  Chanock SJ,  Rothman N,  Hartge P,  Skibola CF
Title: HLA Class I and II Diversity Contributes to the Etiologic Heterogeneity of Non-Hodgkin Lymphoma Subtypes.
Journal: Cancer Res 78(14):4086-4096
Date: 2018 Jul 15
Branches: EBP, IIB, LGS, MEB, OD, OEEB, REB
PubMed ID: 29735552
PMC ID: PMC6065509

Authors: Bogdanova TI,  Saenko VA,  Brenner AV,  Zurnadzhy LY,  Rogounovitch TI,  Likhtarov IA,  Masiuk SV,  Kovgan LM,  Shpak VM,  Thomas GA,  Chanock SJ,  Mabuchi K,  Tronko MD,  Yamashita S
Title: Comparative Histopathologic Analysis of "Radiogenic" and "Sporadic" Papillary Thyroid Carcinoma: Patients Born Before and After the Chernobyl Accident.
Journal: Thyroid 28(7):880-890
Date: 2018 Jul
Branches: LGS, OD, REB
PubMed ID: 29989861
PMC ID: PMC6112184

Authors: Colli Leandro Machado,  Jessop Lea,  Myers Timothy A.,  Machiela Mitchell J.,  Choi Jiyeon,  Purdue Mark,  Brown Kevin,  Chanock Stephen J.
Title: Functional characterization of the 14q24 renal cancer susceptibility locus implicates SWI/SNF complex member DPF3 via inhibition of apoptosis
Journal: Cancer Res 78(13, Suppl S):Abstract 401
Date: 2018 Jul
Branches: CGR, ITEB, LGS, LTG, OD, OEEB
PubMed ID: not available
PMC ID: not available

Authors: Dawson Eric T.,  Wagner Sarah,  Roberson David,  Yeager Meredith,  Boland Joseph,  Garrison Erik,  Schiffman Mark,  Raine-Bennet Tina,  Lorey Thomas,  Castle Phillip,  Chanock Stephen,  Mirabello Lisa,  Durbin Richard
Title: rkmh: A MinHash toolbox for analyzing HPV coinfections
Journal: Cancer Res 78(13, Suppl S):Abstract 3273
Date: 2018 Jul
Branches: CGB, CGR, LGS, OD
PubMed ID: not available
PMC ID: not available

Authors: Koster Roelof,  Panagiotou Orestis A.,  Wheeler William A.,  Karlins Eric,  Gastier-Foster Julie M.,  Caminada de Toledo Silvia Regina,  Petrilli Antonio S.,  Flanagan Adrienne M.,  Tirabosco Roberto,  Andrulis Irene L.,  Wunder Jay S.,  Gokgoz Nalan,  Patino-Garcia Ana,  Lecanda Fernando,  Serra Massimo,  Hattinger Claudia,  Picci Piero,  Scotlandi Katia,  Thomas David M.,  Ballinger Mandy L.,  Gorlick Richard,  Barkauskas Donald A.,  Spector Logan G.,  Tucker Margaret,  Hicks Belynda,  Yeager Meredith,  Hoover Robert,  Chanock Stephen J.,  Savage Sharon A.,  Mirabello Lisa J.
Title: Genome-wide association study identifies the GLDC/IL33 locus associated with survival of osteosarcoma patients
Journal: Cancer Res 78(13, Suppl S):Abstract 2077
Date: 2018 Jul
Branches: CGB, CGR, EBP, HGP, LGS, OD
PubMed ID: not available
PMC ID: not available

Authors: Schumacher FR,  Al Olama AA,  Berndt SI,  Benlloch S,  Ahmed M,  Saunders EJ,  Dadaev T,  Leongamornlert D,  Anokian E,  Cieza-Borrella C,  Goh C,  Brook MN,  Sheng X,  Fachal L,  Dennis J,  Tyrer J,  Muir K,  Lophatananon A,  Stevens VL,  Gapstur SM,  Carter BD,  Tangen CM,  Goodman PJ,  Thompson IM Jr,  Batra J,  Chambers S,  Moya L,  Clements J,  Horvath L,  Tilley W,  Risbridger GP,  Gronberg H,  Aly M,  Nordström T,  Pharoah P,  Pashayan N,  Schleutker J,  Tammela TLJ,  Sipeky C,  Auvinen A,  Albanes D,  Weinstein S,  Wolk A,  HÃ¥kansson N,  West CML,  Dunning AM,  Burnet N,  Mucci LA,  Giovannucci E,  Andriole GL,  Cussenot O,  Cancel-Tassin G,  Koutros S,  Beane Freeman LE,  Sorensen KD,  Orntoft TF,  Borre M,  Maehle L,  Grindedal EM,  Neal DE,  Donovan JL,  Hamdy FC,  Martin RM,  Travis RC,  Key TJ,  Hamilton RJ,  Fleshner NE,  Finelli A,  Ingles SA,  Stern MC,  Rosenstein BS,  Kerns SL,  Ostrer H,  Lu YJ,  Zhang HW,  Feng N,  Mao X,  Guo X,  Wang G,  Sun Z,  Giles GG,  Southey MC,  MacInnis RJ,  FitzGerald LM,  Kibel AS,  Drake BF,  Vega A,  Gómez-Caamaño A,  Szulkin R,  Eklund M,  Kogevinas M,  Llorca J,  Castaño-Vinyals G,  Penney KL,  Stampfer M,  Park JY,  Sellers TA,  Lin HY,  Stanford JL,  Cybulski C,  Wokolorczyk D,  Lubinski J,  Ostrander EA,  Geybels MS,  Nordestgaard BG,  Nielsen SF,  Weischer M,  Bisbjerg R,  Røder MA,  Iversen P,  Brenner H,  Cuk K,  Holleczek B,  Maier C,  Luedeke M,  Schnoeller T,  Kim J,  Logothetis CJ,  John EM,  Teixeira MR,  Paulo P,  Cardoso M,  Neuhausen SL,  Steele L,  Ding YC,  De Ruyck K,  De Meerleer G,  Ost P,  Razack A,  Lim J,  Teo SH,  Lin DW,  Newcomb LF,  Lessel D,  Gamulin M,  Kulis T,  Kaneva R,  Usmani N,  Singhal S,  Slavov C,  Mitev V,  Parliament M,  Claessens F,  Joniau S,  Van den Broeck T,  Larkin S,  Townsend PA,  Aukim-Hastie C,  Gago-Dominguez M,  Castelao JE,  Martinez ME,  Roobol MJ,  Jenster G,  van Schaik RHN,  Menegaux F,  Truong T,  Koudou YA,  Xu J,  Khaw KT,  Cannon-Albright L,  Pandha H,  Michael A,  Thibodeau SN,  McDonnell SK,  Schaid DJ,  Lindstrom S,  Turman C,  Ma J,  Hunter DJ,  Riboli E,  Siddiq A,  Canzian F,  Kolonel LN,  Le Marchand L,  Hoover RN,  Machiela MJ,  Cui Z,  Kraft P,  Amos CI,  Conti DV,  Easton DF,  Wiklund F,  Chanock SJ,  Henderson BE,  Kote-Jarai Z,  Haiman CA,  Eeles RA,  Profile Study,  Australian Prostate Cancer BioResource (APCB),  IMPACT Study,  Canary PASS Investigators,  Breast and Prostate Cancer Cohort Consortium (BPC3),  PRACTICAL (Prostate Cancer Association Group to Investigate Cancer-Associated Alterations in the Genome) Consortium,  Cancer of the Prostate in Sweden (CAPS),  Prostate Cancer Genome-wide Association Study of Uncommon Susceptibility Loci (PEGASUS),  Genetic Associations and Mechanisms in Oncology (GAME-ON)/Elucidating Loci Involved in Prostate Cancer Susceptibility (ELLIPSE) Consortium
Title: Association analyses of more than 140,000 men identify 63 new prostate cancer susceptibility loci.
Journal: Nat Genet 50(7):928-936
Date: 2018 Jul
Branches: BB, EBP, ITEB, LGS, MEB, OD, OEEB, REB
PubMed ID: 29892016
PMC ID: PMC6568012

Authors: Wong JYY,  Margolis HG,  Machiela M,  Zhou W,  Odden MC,  Psaty BM,  Robbins J,  Jones RR,  Rotter JI,  Chanock SJ,  Rothman N,  Lan Q,  Lee JS
Title: Outdoor air pollution and mosaic loss of chromosome Y in older men from the Cardiovascular Health Study.
Journal: Environ Int 116:239-247
Date: 2018 Jul
Branches: CGR, ITEB, LGS, OD, OEEB
PubMed ID: 29698900
PMC ID: PMC5971001

Authors: Dadaev T,  Saunders EJ,  Newcombe PJ,  Anokian E,  Leongamornlert DA,  Brook MN,  Cieza-Borrella C,  Mijuskovic M,  Wakerell S,  Olama AAA,  Schumacher FR,  Berndt SI,  Benlloch S,  Ahmed M,  Goh C,  Sheng X,  Zhang Z,  Muir K,  Govindasami K,  Lophatananon A,  Stevens VL,  Gapstur SM,  Carter BD,  Tangen CM,  Goodman P,  Thompson IM Jr,  Batra J,  Chambers S,  Moya L,  Clements J,  Horvath L,  Tilley W,  Risbridger G,  Gronberg H,  Aly M,  Nordström T,  Pharoah P,  Pashayan N,  Schleutker J,  Tammela TLJ,  Sipeky C,  Auvinen A,  Albanes D,  Weinstein S,  Wolk A,  Hakansson N,  West C,  Dunning AM,  Burnet N,  Mucci L,  Giovannucci E,  Andriole G,  Cussenot O,  Cancel-Tassin G,  Koutros S,  Freeman LEB,  Sorensen KD,  Orntoft TF,  Borre M,  Maehle L,  Grindedal EM,  Neal DE,  Donovan JL,  Hamdy FC,  Martin RM,  Travis RC,  Key TJ,  Hamilton RJ,  Fleshner NE,  Finelli A,  Ingles SA,  Stern MC,  Rosenstein B,  Kerns S,  Ostrer H,  Lu YJ,  Zhang HW,  Feng N,  Mao X,  Guo X,  Wang G,  Sun Z,  Giles GG,  Southey MC,  MacInnis RJ,  FitzGerald LM,  Kibel AS,  Drake BF,  Vega A,  Gómez-Caamaño A,  Fachal L,  Szulkin R,  Eklund M,  Kogevinas M,  Llorca J,  Castaño-Vinyals G,  Penney KL,  Stampfer M,  Park JY,  Sellers TA,  Lin HY,  Stanford JL,  Cybulski C,  Wokolorczyk D,  Lubinski J,  Ostrander EA,  Geybels MS,  Nordestgaard BG,  Nielsen SF,  Weisher M,  Bisbjerg R,  Røder MA,  Iversen P,  Brenner H,  Cuk K,  Holleczek B,  Maier C,  Luedeke M,  Schnoeller T,  Kim J,  Logothetis CJ,  John EM,  Teixeira MR,  Paulo P,  Cardoso M,  Neuhausen SL,  Steele L,  Ding YC,  De Ruyck K,  De Meerleer G,  Ost P,  Razack A,  Lim J,  Teo SH,  Lin DW,  Newcomb LF,  Lessel D,  Gamulin M,  Kulis T,  Kaneva R,  Usmani N,  Slavov C,  Mitev V,  Parliament M,  Singhal S,  Claessens F,  Joniau S,  Van den Broeck T,  Larkin S,  Townsend PA,  Aukim-Hastie C,  Gago-Dominguez M,  Castelao JE,  Martinez ME,  Roobol MJ,  Jenster G,  van Schaik RHN,  Menegaux F,  Truong T,  Koudou YA,  Xu J,  Khaw KT,  Cannon-Albright L,  Pandha H,  Michael A,  Kierzek A,  Thibodeau SN,  McDonnell SK,  Schaid DJ,  Lindstrom S,  Turman C,  Ma J,  Hunter DJ,  Riboli E,  Siddiq A,  Canzian F,  Kolonel LN,  Le Marchand L,  Hoover RN,  Machiela MJ,  Kraft P,  PRACTICAL (Prostate Cancer Association Group to Investigate Cancer-Associated Alterations in the Genome) Consortium,  Freedman M,  Wiklund F,  Chanock S,  Henderson BE,  Easton DF,  Haiman CA,  Eeles RA,  Conti DV,  Kote-Jarai Z
Title: Fine-mapping of prostate cancer susceptibility loci in a large meta-analysis identifies candidate causal variants.
Journal: Nat Commun 9(1):2256
Date: 2018 Jun 11
Branches: BB, CGR, EBP, ITEB, LGS, MEB, OD, OEEB, REB
PubMed ID: 29892050
PMC ID: PMC5995836

Authors: Kleinstern G,  Camp NJ,  Goldin LR,  Vachon CM,  Vajdic CM,  de Sanjose S,  Weinberg JB,  Benavente Y,  Casabonne D,  Liebow M,  Nieters A,  Hjalgrim H,  Melbye M,  Glimelius B,  Adami HO,  Boffetta P,  Brennan P,  Maynadie M,  McKay J,  Cocco PL,  Shanafelt TD,  Call TG,  Norman AD,  Hanson C,  Robinson D,  Chaffee KG,  Brooks-Wilson AR,  Monnereau A,  Clavel J,  Glenn M,  Curtin K,  Conde L,  Bracci PM,  Morton LM,  Cozen W,  Severson RK,  Chanock SJ,  Spinelli JJ,  Johnston JB,  Rothman N,  Skibola CF,  Leis JF,  Kay NE,  Smedby KE,  Berndt SI,  Cerhan JR,  Caporaso N,  Slager SL
Title: Association of polygenic risk score with the risk of chronic lymphocytic leukemia and monoclonal B-cell lymphocytosis.
Journal: Blood 131(23):2541-2551
Date: 2018 Jun 7
Branches: EBP, IIB, ITEB, LGS, OD, OEEB, REB
PubMed ID: 29674426
PMC ID: PMC5992865

Authors: Efanov Alexey A,  Brenner Alina V,  Bogdanova Tetiana I,  Kelly Lindsey M,  Liu Pengyuan,  Little Mark P,  Wald Abigail I,  Hatch Maureen,  Zurnadzy Liudmyla Y,  Nikiforova Marina N,  Drozdovitch Vladimir,  Leeman-Neill Rebecca,  Mabuchi Kiyohiko,  Tronko Mykola D,  Chanock Stephen J,  Nikiforov Yuri E
Title: Corrigendum to "Investigation of the Relationship Between Radiation Dose and Gene Mutations and Fusions in Post-Chernobyl Thyroid Cancer".
Journal: J Natl Cancer Inst 110(6):685
Date: 2018 Jun 1
Branches: LGS, OD, REB
PubMed ID: 29608689
PMC ID: PMC6005104

Authors: Neumeyer S,  Banbury BL,  Arndt V,  Berndt SI,  Bezieau S,  Bien SA,  Buchanan DD,  Butterbach K,  Caan BJ,  Campbell PT,  Casey G,  Chan AT,  Chanock SJ,  Dai JY,  Gallinger S,  Giovannucci EL,  Giles GG,  Grady WM,  Hampe J,  Hoffmeister M,  Hopper JL,  Hsu L,  Jenkins MA,  Joshi A,  Larsson SC,  Le Marchand L,  Lindblom A,  Moreno V,  Lemire M,  Li L,  Lin Y,  Offit K,  Newcomb PA,  Pharaoh PD,  Potter JD,  Qi L,  Rennert G,  Schafmayer C,  Schoen RE,  Slattery ML,  Song M,  Ulrich CM,  Win AK,  White E,  Wolk A,  Woods MO,  Wu AH,  Gruber SB,  Brenner H,  Peters U,  Chang-Claude J
Title: Mendelian randomisation study of age at menarche and age at menopause and the risk of colorectal cancer.
Journal: Br J Cancer 118(12):1639-1647
Date: 2018 Jun
Branches: LGS, MEB, OD, OEEB
PubMed ID: 29795306
PMC ID: PMC6008474

Authors: Zhou W,  Goldin L,  Wang M,  McMaster ML,  Jones K,  Burdett L,  Chanock SJ,  Yeager M,  Dean M,  Caporaso NE
Title: Combined somatic mutation and copy number analysis in the survival of familial CLL.
Journal: Br J Haematol 181(5):604-613
Date: 2018 Jun
Branches: CGB, CGR, ITEB, LGS, LTG, OD, OEEB
PubMed ID: 29687880
PMC ID: PMC6010231

Authors: Antwi SO,  Bamlet WR,  Pedersen KS,  Chaffee KG,  Risch HA,  Shivappa N,  Steck SE,  Anderson KE,  Bracci PM,  Polesel J,  Serraino D,  La Vecchia C,  Bosetti C,  Li D,  Oberg AL,  Arslan AA,  Albanes D,  Duell EJ,  Huybrechts I,  Amundadottir LT,  Hoover R,  Mannisto S,  Chanock S,  Zheng W,  Shu XO,  Stepien M,  Canzian F,  Bueno-de-Mesquita B,  Quirós JR,  Zeleniuch-Jacquotte A,  Bruinsma F,  Milne RL,  Giles GG,  Hébert JR,  Stolzenberg-Solomon RZ,  Petersen GM
Title: Pancreatic Cancer Risk is Modulated by Inflammatory Potential of Diet and ABO Genotype: A Consortia-based Evaluation and Replication Study.
Journal: Carcinogenesis
Date: 2018 May 25
Branches: EBP, LGS, LTG, MEB, OD
PubMed ID: 29800239
PMC ID: PMC6067129

Authors: Ostrom QT,  Kinnersley B,  Wrensch MR,  Eckel-Passow JE,  Armstrong G,  Rice T,  Chen Y,  Wiencke JK,  McCoy LS,  Hansen HM,  Amos CI,  Bernstein JL,  Claus EB,  Il'yasova D,  Johansen C,  Lachance DH,  Lai RK,  Merrell RT,  Olson SH,  Sadetzki S,  Schildkraut JM,  Shete S,  Rubin JB,  Lathia JD,  Berens ME,  Andersson U,  Rajaraman P,  Chanock SJ,  Linet MS,  Wang Z,  Yeager M,  GliomaScan consortium,  Houlston RS,  Jenkins RB,  Melin B,  Bondy ML,  Barnholtz-Sloan JS
Title: Sex-specific glioma genome-wide association study identifies new risk locus at 3p21.31 in females, and finds sex-differences in risk at 8q24.21.
Journal: Sci Rep 8(1):7352
Date: 2018 May 9
Branches: CGR, ITEB, LGS, MEB, OD, OEEB, REB
PubMed ID: 29743610
PMC ID: PMC5943590

Authors: Su YR,  Di C,  Bien S,  Huang L,  Dong X,  Abecasis G,  Berndt S,  Bezieau S,  Brenner H,  Caan B,  Casey G,  Chang-Claude J,  Chanock S,  Chen S,  Connolly C,  Curtis K,  Figueiredo J,  Gala M,  Gallinger S,  Harrison T,  Hoffmeister M,  Hopper J,  Huyghe JR,  Jenkins M,  Joshi A,  Le Marchand L,  Newcomb P,  Nickerson D,  Potter J,  Schoen R,  Slattery M,  White E,  Zanke B,  Peters U,  Hsu L
Title: A Mixed-Effects Model for Powerful Association Tests in Integrative Functional Genomics.
Journal: Am J Hum Genet 102(5):904-919
Date: 2018 May 3
Branches: LGS, MEB, OD, OEEB
PubMed ID: 29727690
PMC ID: PMC5986723

Authors: McMaster ML,  Sun C,  Landi MT,  Savage SA,  Rotunno M,  Yang XR,  Jones K,  Vogt A,  Hutchinson A,  Zhu B,  Wang M,  Hicks B,  Thirunavukarason A,  Stewart DR,  Koutros S,  Goldstein AM,  Chanock SJ,  Caporaso NE,  Tucker MA,  Goldin LR,  Liu Y
Title: Germline mutations in Protection of Telomeres 1 in two families with Hodgkin lymphoma.
Journal: Br J Haematol 181(3):372-377
Date: 2018 May
Branches: BB, CGB, CGR, HGP, ITEB, LGS, OD, OEEB
PubMed ID: 29693246
PMC ID: PMC5921926

Authors: Wang Y,  Gray DR,  Robbins AK,  Crowgey EL,  Chanock SJ,  Greene MH,  McGlynn KA,  Nathanson K,  Turnbull C,  Wang Z,  Devoto M,  Barthold JS,  Testicular Cancer Consortium
Title: Subphenotype meta-analysis of testicular cancer genome-wide association study data suggests a role for RBFOX family genes in cryptorchidism susceptibility.
Journal: Hum Reprod 33(5):967-977
Date: 2018 May 1
Branches: CGB, CGR, LGS, MEB, OD
PubMed ID: 29618007
PMC ID: PMC5925768

Authors: Zhang H,  Wu CO,  Yang Y,  Berndt SI,  Chanock SJ,  Yu K
Title: A multi-locus genetic association test for a dichotomous trait and its secondary phenotype.
Journal: Stat Methods Med Res 27(5):1464-1475
Date: 2018 May
Branches: BB, LGS, OD, OEEB
PubMed ID: 27507288
PMC ID: PMC6474783

Authors: Koster R,  Panagiotou OA,  Wheeler WA,  Karlins E,  Gastier-Foster JM,  Caminada de Toledo SR,  Petrilli AS,  Flanagan AM,  Tirabosco R,  Andrulis IL,  Wunder JS,  Gokgoz N,  Patiño-Garcia A,  Lecanda F,  Serra M,  Hattinger C,  Picci P,  Scotlandi K,  Thomas DM,  Ballinger ML,  Gorlick R,  Barkauskas DA,  Spector LG,  Tucker M,  Belynda DH,  Yeager M,  Hoover RN,  Wacholder S,  Chanock SJ,  Savage SA,  Mirabello L
Title: Genome-wide association study identifies the GLDC/IL33 locus associated with survival of osteosarcoma patients.
Journal: Int J Cancer 142(8):1594-1601
Date: 2018 Apr 15
Branches: BB, CGB, CGR, EBP, HGP, LGS, OD
PubMed ID: 29210060
PMC ID: PMC5814322

Authors: Ghoussaini M,  Edwards SL,  Michailidou K,  Nord S,  Cowper-Sal Lari R,  Desai K,  Kar S,  Hillman KM,  Kaufmann S,  Glubb DM,  Beesley J,  Dennis J,  Bolla MK,  Wang Q,  Dicks E,  Guo Q,  Schmidt MK,  Shah M,  Luben R,  Brown J,  Czene K,  Darabi H,  Eriksson M,  Klevebring D,  Bojesen SE,  Nordestgaard BG,  Nielsen SF,  Flyger H,  Lambrechts D,  Thienpont B,  Neven P,  Wildiers H,  Broeks A,  Van't Veer LJ,  Rutgers EJT,  Couch FJ,  Olson JE,  Hallberg E,  Vachon C,  Chang-Claude J,  Rudolph A,  Seibold P,  Flesch-Janys D,  Peto J,  Dos-Santos-Silva I,  Gibson L,  Nevanlinna H,  Muranen TA,  Aittomäki K,  Blomqvist C,  Hall P,  Li J,  Liu J,  Humphreys K,  Kang D,  Choi JY,  Park SK,  Noh DY,  Matsuo K,  Ito H,  Iwata H,  Yatabe Y,  Guénel P,  Truong T,  Menegaux F,  Sanchez M,  Burwinkel B,  Marme F,  Schneeweiss A,  Sohn C,  Wu AH,  Tseng CC,  Van Den Berg D,  Stram DO,  Benitez J,  Pilar Zamora M,  Perez JIA,  Menéndez P,  Shu XO,  Lu W,  Gao YT,  Cai Q,  Cox A,  Cross SS,  Reed MWR,  Andrulis IL,  Knight JA,  Glendon G,  Tchatchou S,  Sawyer EJ,  Tomlinson I,  Kerin MJ,  Miller N,  Haiman CA,  Henderson BE,  Schumacher F,  Le Marchand L,  Lindblom A,  Margolin S,  Teo SH,  Yip CH,  Lee DSC,  Wong TY,  Hooning MJ,  Martens JWM,  Collée JM,  van Deurzen CHM,  Hopper JL,  Southey MC,  Tsimiklis H,  Kapuscinski MK,  Shen CY,  Wu PE,  Yu JC,  Chen ST,  Alnæs GG,  Borresen-Dale AL,  Giles GG,  Milne RL,  McLean C,  Muir K,  Lophatananon A,  Stewart-Brown S,  Siriwanarangsan P,  Hartman M,  Miao H,  Buhari SABS,  Teo YY,  Fasching PA,  Haeberle L,  Ekici AB,  Beckmann MW,  Brenner H,  Dieffenbach AK,  Arndt V,  Stegmaier C,  Swerdlow A,  Ashworth A,  Orr N,  Schoemaker MJ,  García-Closas M,  Figueroa J,  Chanock SJ,  Lissowska J,  Simard J,  Goldberg MS,  Labrèche F,  Dumont M,  Winqvist R,  Pylkäs K,  Jukkola-Vuorinen A,  Brauch H,  Brüning T,  Koto YD,  Radice P,  Peterlongo P,  Bonanni B,  Volorio S,  Dörk T,  Bogdanova NV,  Helbig S,  Mannermaa A,  Kataja V,  Kosma VM,  Hartikainen JM,  Devilee P,  Tollenaar RAEM,  Seynaeve C,  Van Asperen CJ,  Jakubowska A,  Lubinski J,  Jaworska-Bieniek K,  Durda K,  Slager S,  Toland AE,  Ambrosone CB,  Yannoukakos D,  Sangrajrang S,  Gaborieau V,  Brennan P,  McKay J,  Hamann U,  Torres D,  Zheng W,  Long J,  Anton-Culver H,  Neuhausen SL,  Luccarini C,  Baynes C,  Ahmed S,  Maranian M,  Healey CS,  González-Neira A,  Pita G,  Rosario Alonso M,  Álvarez N,  Herrero D,  Tessier DC,  Vincent D,  Bacot F,  de Santiago I,  Carroll J,  Caldas C,  Brown MA,  Lupien M,  Kristensen VN,  Pharoah PDP,  Chenevix-Trench G,  French JD,  Easton DF,  Dunning AM
Title: Publisher Correction: Evidence that breast cancer risk at the 2q35 locus is mediated through IGFBP5 regulation.
Journal: Nat Commun 9:16193
Date: 2018 Apr 10
Branches: ITEB, LGS, MEB, OD, OEEB
PubMed ID: 29633761
PMC ID: PMC5898457

Authors: Vijayakrishnan J,  Studd J,  Broderick P,  Kinnersley B,  Holroyd A,  Law PJ,  Kumar R,  Allan JM,  Harrison CJ,  Moorman AV,  Vora A,  Roman E,  Rachakonda S,  Kinsey SE,  Sheridan E,  Thompson PD,  Irving JA,  Koehler R,  Hoffmann P,  Nöthen MM,  Heilmann-Heimbach S,  Jöckel KH,  Easton DF,  Pharaoh PDP,  Dunning AM,  Peto J,  Canzian F,  Swerdlow A,  Eeles RA,  Kote-Jarai Z,  Muir K,  Pashayan N,  PRACTICAL Consortium,  Greaves M,  Zimmerman M,  Bartram CR,  Schrappe M,  Stanulla M,  Hemminki K,  Houlston RS
Title: Genome-wide association study identifies susceptibility loci for B-cell childhood acute lymphoblastic leukemia.
Journal: Nat Commun 9(1):1340
Date: 2018 Apr 9
Branches: LGS, MEB, OD, OEEB
PubMed ID: 29632299
PMC ID: PMC5890276

Authors: Disney-Hogg L,  Sud A,  Law PJ,  Cornish AJ,  Kinnersley B,  Ostrom QT,  Labreche K,  Eckel-Passow JE,  Armstrong GN,  Claus EB,  Il'yasova D,  Schildkraut J,  Barnholtz-Sloan JS,  Olson SH,  Bernstein JL,  Lai RK,  Swerdlow AJ,  Simon M,  Hoffmann P,  Nöthen MM,  Jöckel KH,  Chanock S,  Rajaraman P,  Johansen C,  Jenkins RB,  Melin BS,  Wrensch MR,  Sanson M,  Bondy ML,  Houlston RS
Title: Influence of obesity-related risk factors in the aetiology of glioma.
Journal: Br J Cancer 118(7):1020-1027
Date: 2018 Apr
Branches: LGS, OD, REB
PubMed ID: 29531326
PMC ID: PMC5931112

Authors: Efanov AA,  Brenner AV,  Bogdanova TI,  Kelly LM,  Liu P,  Little MP,  Wald AI,  Hatch M,  Zurnadzy LY,  Nikiforova MN,  Drozdovitch V,  Leeman-Neill R,  Mabuchi K,  Tronko MD,  Chanock SJ,  Nikiforov YE
Title: Investigation of the Relationship Between Radiation Dose and Gene Mutations and Fusions in Post-Chernobyl Thyroid Cancer.
Journal: J Natl Cancer Inst 110(4):371-378
Date: 2018 Apr 1
Branches: LGS, OD, REB
PubMed ID: 29165687
PMC ID: PMC6059206

Authors: Barrdahl M,  Canzian F,  Gaudet MM,  Gapstur SM,  Trichopoulou A,  Tsilidis K,  van Gils CH,  Borgquist S,  Weiderpass E,  Khaw KT,  Giles GG,  Milne RL,  Le Marchand L,  Haiman C,  Lindström S,  Kraft P,  Hunter DJ,  Ziegler R,  Chanock SJ,  Yang XR,  Buring JE,  Lee IM,  Kaaks R,  Campa D
Title: A comprehensive analysis of polymorphic variants in steroid hormone and insulin-like growth factor-1 metabolism and risk of in situ breast cancer: Results from the Breast and Prostate Cancer Cohort Consortium.
Journal: Int J Cancer 142(6):1182-1188
Date: 2018 Mar 15
Branches: EBP, LGS, MEB, OD
PubMed ID: 29114882
PMC ID: PMC6610718

Authors: Disney-Hogg L,  Cornish AJ,  Sud A,  Law PJ,  Kinnersley B,  Jacobs DI,  Ostrom QT,  Labreche K,  Eckel-Passow JE,  Armstrong GN,  Claus EB,  Il'yasova D,  Schildkraut J,  Barnholtz-Sloan JS,  Olson SH,  Bernstein JL,  Lai RK,  Schoemaker MJ,  Simon M,  Hoffmann P,  Nöthen MM,  Jöckel KH,  Chanock S,  Rajaraman P,  Johansen C,  Jenkins RB,  Melin BS,  Wrensch MR,  Sanson M,  Bondy ML,  Houlston RS
Title: Impact of atopy on risk of glioma: a Mendelian randomisation study.
Journal: BMC Med 16(1):42
Date: 2018 Mar 15
Branches: LGS, OD, REB
PubMed ID: 29540232
PMC ID: PMC5853158

Authors: Dagnall CL,  Morton LM,  Hicks BD,  Li S,  Zhou W,  Karlins E,  Teshome K,  Chowdhury S,  Lashley KS,  Sampson JN,  Robison LL,  Armstrong GT,  Bhatia S,  Radloff GA,  Davies SM,  Tucker MA,  Yeager M,  Chanock SJ
Title: Successful use of whole genome amplified DNA from multiple source types for high-density Illumina SNP microarrays.
Journal: BMC Genomics 19(1):182
Date: 2018 Mar 6
Branches: BB, CGR, HGP, LGS, OD, REB
PubMed ID: 29510662
PMC ID: PMC5838969

Authors: Hu Y,  Gaedcke J,  Emons G,  Beissbarth T,  Grade M,  Jo P,  Yeager M,  Chanock SJ,  Wolff H,  Camps J,  Ghadimi BM,  Ried T
Title: Colorectal cancer susceptibility loci as predictive markers of rectal cancer prognosis after surgery.
Journal: Genes Chromosomes Cancer 57(3):140-149
Date: 2018 Mar
Branches: CGR, LGS, OD
PubMed ID: 29119627
PMC ID: PMC5778444

Authors: Machiela MJ,  Chanock SJ
Title: LDassoc: an online tool for interactively exploring genome-wide association study results and prioritizing variants for functional investigation.
Journal: Bioinformatics 34(5):887-889
Date: 2018 Mar 1
Branches: ITEB, LGS, OD
PubMed ID: 28968746
PMC ID: PMC6030966

Authors: Zhang M,  Lykke-Andersen S,  Zhu B,  Xiao W,  Hoskins JW,  Zhang X,  Rost LM,  Collins I,  Bunt MV,  Jia J,  Parikh H,  Zhang T,  Song L,  Jermusyk A,  Chung CC,  Zhu B,  Zhou W,  Matters GL,  Kurtz RC,  Yeager M,  Jensen TH,  Brown KM,  Ongen H,  Bamlet WR,  Murray BA,  McCarthy MI,  Chanock SJ,  Chatterjee N,  Wolpin BM,  Smith JP,  Olson SH,  Petersen GM,  Shi J,  Amundadottir L
Title: Characterising cis-regulatory variation in the transcriptome of histologically normal and tumour-derived pancreatic tissues.
Journal: Gut 67(3):521-533
Date: 2018 Mar
Branches: BB, CGR, ITEB, LGS, LTG, OD
PubMed ID: 28634199
PMC ID: PMC5762429

Authors: Klein AP,  Wolpin BM,  Risch HA,  Stolzenberg-Solomon RZ,  Mocci E,  Zhang M,  Canzian F,  Childs EJ,  Hoskins JW,  Jermusyk A,  Zhong J,  Chen F,  Albanes D,  Andreotti G,  Arslan AA,  Babic A,  Bamlet WR,  Beane-Freeman L,  Berndt SI,  Blackford A,  Borges M,  Borgida A,  Bracci PM,  Brais L,  Brennan P,  Brenner H,  Bueno-de-Mesquita B,  Buring J,  Campa D,  Capurso G,  Cavestro GM,  Chaffee KG,  Chung CC,  Cleary S,  Cotterchio M,  Dijk F,  Duell EJ,  Foretova L,  Fuchs C,  Funel N,  Gallinger S,  M Gaziano JM,  Gazouli M,  Giles GG,  Giovannucci E,  Goggins M,  Goodman GE,  Goodman PJ,  Hackert T,  Haiman C,  Hartge P,  Hasan M,  Hegyi P,  Helzlsouer KJ,  Herman J,  Holcatova I,  Holly EA,  Hoover R,  Hung RJ,  Jacobs EJ,  Jamroziak K,  Janout V,  Kaaks R,  Khaw KT,  Klein EA,  Kogevinas M,  Kooperberg C,  Kulke MH,  Kupcinskas J,  Kurtz RJ,  Laheru D,  Landi S,  Lawlor RT,  Lee IM,  LeMarchand L,  Lu L,  Malats N,  Mambrini A,  Mannisto S,  Milne RL,  Mohelníková-Duchoňová B,  Neale RE,  Neoptolemos JP,  Oberg AL,  Olson SH,  Orlow I,  Pasquali C,  Patel AV,  Peters U,  Pezzilli R,  Porta M,  Real FX,  Rothman N,  Scelo G,  Sesso HD,  Severi G,  Shu XO,  Silverman D,  Smith JP,  Soucek P,  Sund M,  Talar-Wojnarowska R,  Tavano F,  Thornquist MD,  Tobias GS,  Van Den Eeden SK,  Vashist Y,  Visvanathan K,  Vodicka P,  Wactawski-Wende J,  Wang Z,  Wentzensen N,  White E,  Yu H,  Yu K,  Zeleniuch-Jacquotte A,  Zheng W,  Kraft P,  Li D,  Chanock S,  Obazee O,  Petersen GM,  Amundadottir LT
Title: Genome-wide meta-analysis identifies five new susceptibility loci for pancreatic cancer.
Journal: Nat Commun 9(1):556
Date: 2018 Feb 8
Branches: BB, CGB, CGR, EBP, LGS, LTG, MEB, OD, OEEB
PubMed ID: 29422604
PMC ID: PMC5805680

Authors: Takahashi H,  Cornish AJ,  Sud A,  Law PJ,  Kinnersley B,  Ostrom QT,  Labreche K,  Eckel-Passow JE,  Armstrong GN,  Claus EB,  Il'yasova D,  Schildkraut J,  Barnholtz-Sloan JS,  Olson SH,  Bernstein JL,  Lai RK,  Schoemaker MJ,  Simon M,  Hoffmann P,  Nöthen MM,  Jöckel KH,  Chanock S,  Rajaraman P,  Johansen C,  Jenkins RB,  Melin BS,  Wrensch MR,  Sanson M,  Bondy ML,  Turnbull C,  Houlston RS
Title: Mendelian randomisation study of the relationship between vitamin D and risk of glioma.
Journal: Sci Rep 8(1):2339
Date: 2018 Feb 5
Branches: LGS, OD, REB
PubMed ID: 29402980
PMC ID: PMC5799201

Authors: Goldstein AM,  Xiao Y,  Sampson J,  Zhu B,  Rotunno M,  Bennett H,  Wen Y,  Jones K,  Vogt A,  Burdette L,  Luo W,  Zhu B,  Yeager M,  Hicks B,  Han J,  De Vivo I,  Koutros S,  Andreotti G,  Beane-Freeman L,  Purdue M,  Freedman ND,  Chanock SJ,  Tucker MA,  Yang XR
Title: Rare germline variants in known melanoma susceptibility genes in familial melanoma.
Journal: Hum Mol Genet 26(24):4886-4895
Date: 2017 Dec 15
Branches: BB, CGB, CGR, HGP, ITEB, LGS, MEB, OD, OEEB
PubMed ID: 29036293
PMC ID: PMC5886297